| od 1.10.1994 | do 30.6.1996 | podplukovník Ing. Zdeněk HANKO |
| od 1. 7.1996 | do 31.5.1998 | podplukovník Ing. Jiří MAREK |
| od 1. 6.1998 | do 31.8.2001 | podplukovník Ing. Miroslav KŰHTREIBER |
| od 1. 9.2001 | do 31. 1. 2004 | podplukovník Ing. Zdeněk HAVALA |
| od. 1. 2. 2004 | do 10. 6. 2004 | mjr. Ing. Pavel LIPKA (z pověření) |
| od 11.6.2004 | do 9.9.2005 | podplukovník Ing. Ivo STŘECHA |
| od 9. 9.2005 | do 31.3.2010 | podplukovník Ing. Pavel LIPKA |
| od 1. 4.2010 | do 31.5.2015 | podplukovník Ing. Jan ZEZULA Ph.D. |
| od 1.6.2015 | do 31.8.2017 |
podplukovník gšt. Ing. Tibor BUDÍK |
| od 1.9.2017 | podplukovník Ing. Petr BLECHA |
